06月14 動物研究百邁客云解決方案-BMKCloud_數據庫收錄的豬屬數據所涉及研究方向
解決方案概述
針對動物基因組學研究，百邁客云可通過BMKCloud_數據庫模塊向用戶提供海量的動物高通量測序公共數據，借助公共數據，可大幅降低研究成本，提升研究層次。數據檢索、下載、保存均在圖形化界面下完成，避免了傳統模式中，須在命令行界面下進行數據下載、格式轉換等一系列繁瑣操作的限制，完全適用于國內生信0基礎的用戶。
對于公共數據的下游分析，百邁客云目前已實現公共數據模塊與分析模塊的無縫對接，用戶可直接將已保存至用戶目錄的數據直接導入BMKCloud_APP分析模塊進行下游分析，該模塊同樣采用圖形化操作界面，無需用戶掌握任何編程基礎，高度集成化專業(yè)化的分析流程可保證用戶快速完成對數據的基礎分析以及必要的數據深度挖掘。
整合mRNA公共測序數據，構建豬肉品質相關miRNA-mRNA調控網絡
方案實現過程
1）進入BMKCloud_數據庫模塊進行數據檢索與保存。
2）進入BMKCloud_APP模塊，簡單5步完成公共數據or自測數據導入及任務投遞。
3）分析結果自動生成，繼續(xù)使用個性化分析模快速完成數據深度挖掘。
BMKCloud_數據庫收錄的豬屬數據所涉及研究方向：
疾病類研究：豬多系統衰竭綜合征、豬生殖呼吸道綜合征、支氣管哮喘、豬偽狂犬病、豬弓形蟲病、全反式維甲酸&抗病、豬圓環(huán)病毒感染、鼠傷寒沙門菌感染、口蹄疫病毒感染、豬巨細胞病毒感染、脊髓損傷……
生長發(fā)育類研究：繁殖力、同胎生仔數、胚胎發(fā)育、豬卵巢發(fā)育、生長速度、豬肉品質、食欲、脂肪組織發(fā)育、肌肉組織發(fā)育、豬背最長肌分化……
其他：基因組組裝、環(huán)境適應、遺傳進化……
文章思路
Khan FA et al. ? Analysis of Bos taurus and Sus scrofa X and Y chromosome transcriptome highlights reproductive driver genes. ? Oncotarget. 2017
百邁客云實現方案
